種子冷庫用于貯藏種子，可以更好的提高農業生產種子播種質量，是可靠的物質基礎。
種子冷庫可以用于貯藏雜交玉米、水稻種子等，根據觀察分析明確種子適宜冷藏庫貯藏的平均相對溫度是11.2℃，平均相對濕度為63.8%。在種子冷庫貯藏兩年的種子檢測分析表現，種子的水分基本不變，冷藏庫貯藏的種子經濟效益也是非常明顯的，根據分析顯示雜交水稻種子和雜交玉米種子的發芽率分別只下降2.5%和4.0%。
種子冷庫貯藏種子也是需要按種子所貯藏時間對冷庫設計相對合適的冷庫溫度和濕度。
1.短期種子冷庫 也就是根據冷藏庫設計的貯藏的條件，生產性種子可保存壽命預期在2~5年。短期種子冷庫設計溫度控制在15℃～20℃，冷庫相對濕度控制在50%～60%；種子貯藏時可用紙袋、布袋、塑料袋及玻璃容積包裝貯藏。
2.中期種子冷庫 用于貯藏流動性種子，其種子壽命預期時候在10～30年。種子冷庫設計相對溫度控制在0℃～10℃，相對濕度不大于60%；中期種子冷庫貯藏在如：金屬盒、玻璃容積、鋁箔袋、塑料復合膜袋等不透氣的容積內，保持種子含水量在6%～9%。
3.長期種子冷庫 用于長時間保存種子，可以保持種子壽命在30～50年，或者更長時間。
根據國際長期保持種子參考溫度為-18℃或是更低，種子含水量為5±1%；所以長期種子冷藏冷庫設計的相對溫度控制在-10℃～-20℃，相對溫度不大于60%。用于長期貯藏的種子包裝和中期貯藏包裝是一樣的，一定要不透氣。
種子冷庫的組成：制冷設備制冷、蒸發器，保溫板，微電腦溫控系統及節流裝置等設備組成。
